Az intézet feladata kettős: a magyar kultúra közvetítése a horvátoknak, és otthonul szolgál a horvátországi magyar közösség számára. Programjai Eszéken és a Drávaszögben is megjelennek. A zágrábi Ady Endre Kör segítségével már eddig is jó kapcsolat alakult ki a horvátországi magyarok között.
A magyar intézet munkatársai „busójárást” szerveznek Mohácsról Zágrábba, mivel az UNESCO az emberiség szellemi kulturális öröksége listáján is szereplő mohácsi busójárás voltaképp egy horvát kisebbségi csoport, a sokácok népszokása, melynek hagyománya párhuzamosan Horvátországban is él, ezáltal kapcsolódási pont a két kultúra között.
A zágrábi magyar intézet igazgatója, Sokcsevits Dénes a családjában tanult meg horvátul. Harmincöt évvel ezelőtt, a Magyar Népköztársaság és a Jugoszláv Szocialista Szövetségi Köztársaság egyezménye alapján állami (nemzetiségi) ösztöndíjasként kezdte meg egyetemi tanulmányait. Előbb Újvidéken járt délszláv nyelvek és irodalmak szakra, majd a Zágrábi Egyetemen folytatta tanulmányait. Akkor kezdett műfordításokkal foglalkozni; 1990-ben lett a Pécsi Egyetem horvát tanszékének munkatársa. Vendégtanárként tanított a Zágrábi Egyetem horvát stúdiumok történelem szakán, majd az Eszéki Egyetem hungarológia-szakán magyar történelmi témájú tárgyakat. Történeti tárgyú könyveket írt, mintegy száz cikke és tanulmánya jelent meg.
Első, magyar nyelvű, a horvát történelemről szóló, nagy terjedelmű összefoglaló munkája – Horvátország története a 7. századtól napjainkig címmel – Budapesten jelent meg. A Pécsi Tudományegyetem Bölcsészettudományi Kara Szlavisztika Intézetének igazgatója, illetve az MTA Bölcsészettudományi Kutatóközpont Történettudományi Intézetének tudományos főmunkatársa 2008 óta.
