A GYSEV az állami vasúttársasággal közösen Szombathelyről naponta további két vonatpárt közlekedtet. A Szombathely–Tapolca–Balatonfüred–Budapest Déli pályaudvar járat gyorsvonatként a Balaton északi, a Szombathely–Tapolca–Keszthely–Fonyód–Kaposvár sebesvonat pedig a tó déli partja felé közlekedik.