A „Data-intensive complex systems approach for cancer genomics research: from theory to efficient targeted therapeutic intervention” (—> Adat-intenzív, komplex rendszer alapú megközelítés a rák genomikában: az elmélettől a célzott hatékony terápiáig) című pályázat orvosbiológusok, genetikusok és fizikusok közös munkájával próbálja felderíteni a rák kialakulása közben végbemenő komplex folyamatokat. A rák klinikai kezelésének eredményességét nagyban hátráltatja, hogy a daganat „mozgó célpont”, folyamatosan változik megjelenése és genetikai összetétele, sőt az áttétekkel a helyét is változtatja.

A körülményeket tovább nehezíti, hogy a kezelések – amelyek maguk is gyakran genetikai módosulásokat okoznak – nyomása elől a sejtek igyekeznek kitérni, így az onkológusok egy folyamatos evolúcióban lévő kórt üldöznek. A konzorcium szakmaiközi megközelítéssel próbálja megérteni a rák-kifejlődés dinamikáját és hozzájárulni az eddiginél hatékonyabb kórfelismeréshez és kezeléshez.

A nemzetközi konzorciumot Jiří Bartek (Dák Rákszövetség) professzor vezeti. A nagyszabású kutatási programban Charles Swanton (The Francis Crick Institute, Egyesült Királyság), Szállási Zoltán (Dán Műszaki Egyetem), valamint hazai résztvevőként Csabai István professzorok kutatócsoportjai vesznek részt. 

Az angol partner, Swanton professzor által vezetett TRACERx kezdeményezésben 845 rákos beteg orvosi és genetikai vizsgálata zajlik, kilenc éven keresztül gyűjtenek adatokat. Bartek professzor dániai laboratóriumában sejttenyészeteken végzett kísérletekkel és a Szállási professzor által kutatott DNS-javító mechanizmusok részletesebb elemzésével a kutatók a kezelések hatását derítik fel. A genetikai szekvenálások várhatóan mintegy 10 petabájtnyi adatmennyiséget eredményeznek, melynek kezelésében nagy szerepet játszanak a Csabai professzor által fejlesztett tudományos adatbázisok és elemző, modellező módszerek, melyeket más területeken már sikerrel alkalmazott.

Az új vizsgálati technikák megjelenésével a rák összetett jelenségének megértését ma már nem annyira az adatok hiánya, hanem a rendszer komplexitása nehezíti leginkább. Ebben segíthetnek a statisztikus fizikában és számítástudományban az elmúlt években kidolgozott módszerek, melyekkel csatolt dinamikai rendszerek vizsgálhatóak.

A szerteágazó tudományterületeken dolgozó kutatók célja, hogy közös munkával, a kísérletek és elemzések összehangolásával kiszűrjék az adatokból a leglényegesebb tényezőket, és megalkossanak egy előrejelzésen alapuló modellt, amely a mostaninál hatékonyabb kezelések tervezését teszi lehetővé és elveztethet a rák felszámolásához.

 

A Novo Nordisk dániai magánalapítvány az egészségügyet és a jóléti szolgáltatásokhoz hozzájáruló kutatásokat támogatja, a szinergiaprogramra beérkezett pályázatok értékelése közben e célok mellett az interdiszciplináris megközelítést és a tudományos kiválóságot vették figyelembe.