A bétatesztelési időszak után elérhetővé vált az Android 5.1 Lollipop operációs rendszer a Honor 6 és a Honor 6 Plus okostelefon modellekre. Az új kezelőfelület új beállítási lehetőségeket és technológiai fejlesztéseket is tartalmaz. Az újdonságok között találhatók a fényképek, a névjegyek és az üzenetek megtekintésének lehetősége vendégként, a nagymértékben fejlődött rendszerüzenetek, valamint a vezeték nélküli hálózatok, a bluetooth- és a gps-beállítások egyszerűbb kezelése. A frissítés után a modellek reakcióideje gyorsabbá válik, és energiagazdálkodásuk is látványosan jobb.